23-12-2024 22:59
Lucian Clanet
Hello,I'm trying to find information about the Hyp
21-12-2024 12:45
Marc Detollenaere
Dear Forum,On naked wood of Fagus, I found some ha
23-12-2024 18:18
Rot BojanHello!I've been working with this small fungus for
23-12-2024 12:10
Bernard CLESSE
Bonjour à toutes et tous,Pourriez-vous m'aider à
17-12-2024 12:33
Lothar Krieglsteiner
this fluffy anamorph was repeatedly found on decid
22-12-2024 10:19
Simon Gurtner
Hello,can anyone help me identify this small ascom
22-12-2024 10:53
Bernard CLESSE
Pourriez-vous me confirmer ma détermination de ce
20-12-2024 17:32
Louis DENYBonsoir forumTrouvé à Belfort, 400 m altitude, s
Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Pierre-Arthur Moreau,
26-06-2009 22:43
Chers tous,Je m'adresse surtout aux spécialistes des Helotiales familiers des travaux moléculaires...
Mes collègues de l'université de Toulouse, qui travaillent avec moi sur les mycorhizes des aulnes, ont obtenu en séquençant des mycorhizes (parmi les Tomentella et les Alnicola) plusieurs séquences d'Helotiales non identifiées (d'après des blasts sur Genbank).
Savez-vous s'il existe des Helotiales ectomycorhiziques, et existe-t-il des spécialistes de la phylogénie moléculaire de ce groupe qui pourraient nous aider à identifier plus précisément ces séquences ITS ? (à part Hymenoscyphus/Pezizella ericae qui forme des ectendomycorhizes avec les Ericaceae, je n'ai rien trouvé dans la littérature à ma disposition)
Merci d'avance ! Amitiés, Pierre-Arthur
Hans-Otto Baral,
26-06-2009 23:29
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Dear Pierre-Arthur
mycorrhiza is actually little known in the Helotiales, but possibly overlooked. I suspect that the genus Pezoloma shows some ability for mycorrhiza, mainly those species with marginal teeth (P. ciliifera and others). There are Finnishworkers on that group (HUhtinen and others) who have sequenced Pezoloma, and I hope these data are soon available in GenBank.
Did you try to find out taxa in GenBank related .to your isolates? Did you put your sequences in GenBank?
Cheers
Zotto
mycorrhiza is actually little known in the Helotiales, but possibly overlooked. I suspect that the genus Pezoloma shows some ability for mycorrhiza, mainly those species with marginal teeth (P. ciliifera and others). There are Finnishworkers on that group (HUhtinen and others) who have sequenced Pezoloma, and I hope these data are soon available in GenBank.
Did you try to find out taxa in GenBank related .to your isolates? Did you put your sequences in GenBank?
Cheers
Zotto
Pierre-Arthur Moreau,
26-06-2009 23:43
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Thanks Zotto ! Pezoloma is a pleasant idea, especially in such peaty substrates. We have just generated these sequences, they are not in Genbank yet.
One of our sequences blasts at 92 % with a "AJ879686 Helotiales"
Four others come out close to EF21218, AY394892, FM997939 (from mycorrhizae of Betula, Ericaceae... and from Cicuta !). But I do not trust single blasts too much.
I will contact Seppo, I hope he will help us by comparing with his Pezoloma sequences.
Cheers ! Pierre-Arthur
One of our sequences blasts at 92 % with a "AJ879686 Helotiales"
Four others come out close to EF21218, AY394892, FM997939 (from mycorrhizae of Betula, Ericaceae... and from Cicuta !). But I do not trust single blasts too much.
I will contact Seppo, I hope he will help us by comparing with his Pezoloma sequences.
Cheers ! Pierre-Arthur
Luc Bailly,
27-06-2009 11:40
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Dans le temps, j'ai un peu travaillé sur les ectomycorrhizes, en suivant le mycélium depuis la fructification jusqu'à la mycorhize. Je pense que des espèces comme Leotia lubrica et Humaria hemisphaerica pourraient être ECM. Tu pourrais peut-être tester ces espèces-là, Pierre-Arthur.
Hans-Otto Baral,
27-06-2009 13:04
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
I remember an unidentified Mollisia species forming a well-known blackish mycorrhiza.
Zotto
Zotto
François Valade,
27-06-2009 18:26
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
PAM
j'ai envoyé Pezoloma ciliifera frais à Seppo, il y a 2 ou 3 ans , récolte au bord du lac noir aux Coches, endroit que tu connais bien.
François
j'ai envoyé Pezoloma ciliifera frais à Seppo, il y a 2 ou 3 ans , récolte au bord du lac noir aux Coches, endroit que tu connais bien.
François
Pierre-Arthur Moreau,
28-06-2009 08:26
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Merci pour vos réponses. Pour Leotia lubrica, j'ai pensé moi aussi qu'il pouvait être mycorhizique, mais sur des lots de mycorhizes d'aulnes provenant de sites où elle est très abondante, nous n'avons isolé aucune séquence correspondante. Ca n'exclut pas qu'elle puisse être mycorhizique des autres arbres présents, bien sûr.
Je pense moi aussi qu'Humaria, et même les Trichophaea, ont des habitudes de poussée qui laissent penser qu'ils sont ectomycorhiziques, mais quant à le démontrer sans l'outil moléculaire, c'est très hasardeux !
Bon dimanche, Pierre-Arthur
Je pense moi aussi qu'Humaria, et même les Trichophaea, ont des habitudes de poussée qui laissent penser qu'ils sont ectomycorhiziques, mais quant à le démontrer sans l'outil moléculaire, c'est très hasardeux !
Bon dimanche, Pierre-Arthur
Luc Bailly,
28-06-2009 09:42
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Re: Humaria: quand on a la chance d'avoir une radicelle mycorrhirée très proche de la base de l'apothécie, on peut voir des hyphes brunes qui rejoignent la mycorrhize. C'est le seul moyen de mettre ces mycorrhizes en évidence: si les mycorrhizes sont plus éloignées, suivre le mycélium ténu, hyalin, dans l'argile, est en effet très hasardeux.