20-05-2025 22:15
Francois Guay
I found this ascomycete at the base of a dead fern
30-05-2025 17:54
Louis DENYHello forum!Touvé près de Belfort, altitude 350m
31-05-2025 00:51
Ethan CrensonHello, Last week in New York City this Orbilia wa
30-05-2025 17:55
Louis DENYHello forum!Touvé près de Belfort, altitude 350m
30-05-2025 12:53
Gernot FriebesHi,I'm struggling to find a name for this species.
28-05-2025 21:19
Terje KristiansenThe rose is intertwined with black elderberry.Prob
Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Pierre-Arthur Moreau,
26-06-2009 22:43
Chers tous,Je m'adresse surtout aux spécialistes des Helotiales familiers des travaux moléculaires...
Mes collègues de l'université de Toulouse, qui travaillent avec moi sur les mycorhizes des aulnes, ont obtenu en séquençant des mycorhizes (parmi les Tomentella et les Alnicola) plusieurs séquences d'Helotiales non identifiées (d'après des blasts sur Genbank).
Savez-vous s'il existe des Helotiales ectomycorhiziques, et existe-t-il des spécialistes de la phylogénie moléculaire de ce groupe qui pourraient nous aider à identifier plus précisément ces séquences ITS ? (à part Hymenoscyphus/Pezizella ericae qui forme des ectendomycorhizes avec les Ericaceae, je n'ai rien trouvé dans la littérature à ma disposition)
Merci d'avance ! Amitiés, Pierre-Arthur
Hans-Otto Baral,
26-06-2009 23:29
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Dear Pierre-Arthur
mycorrhiza is actually little known in the Helotiales, but possibly overlooked. I suspect that the genus Pezoloma shows some ability for mycorrhiza, mainly those species with marginal teeth (P. ciliifera and others). There are Finnishworkers on that group (HUhtinen and others) who have sequenced Pezoloma, and I hope these data are soon available in GenBank.
Did you try to find out taxa in GenBank related .to your isolates? Did you put your sequences in GenBank?
Cheers
Zotto
mycorrhiza is actually little known in the Helotiales, but possibly overlooked. I suspect that the genus Pezoloma shows some ability for mycorrhiza, mainly those species with marginal teeth (P. ciliifera and others). There are Finnishworkers on that group (HUhtinen and others) who have sequenced Pezoloma, and I hope these data are soon available in GenBank.
Did you try to find out taxa in GenBank related .to your isolates? Did you put your sequences in GenBank?
Cheers
Zotto
Pierre-Arthur Moreau,
26-06-2009 23:43
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Thanks Zotto ! Pezoloma is a pleasant idea, especially in such peaty substrates. We have just generated these sequences, they are not in Genbank yet.
One of our sequences blasts at 92 % with a "AJ879686 Helotiales"
Four others come out close to EF21218, AY394892, FM997939 (from mycorrhizae of Betula, Ericaceae... and from Cicuta !). But I do not trust single blasts too much.
I will contact Seppo, I hope he will help us by comparing with his Pezoloma sequences.
Cheers ! Pierre-Arthur
One of our sequences blasts at 92 % with a "AJ879686 Helotiales"
Four others come out close to EF21218, AY394892, FM997939 (from mycorrhizae of Betula, Ericaceae... and from Cicuta !). But I do not trust single blasts too much.
I will contact Seppo, I hope he will help us by comparing with his Pezoloma sequences.
Cheers ! Pierre-Arthur
Luc Bailly,
27-06-2009 11:40
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Dans le temps, j'ai un peu travaillé sur les ectomycorrhizes, en suivant le mycélium depuis la fructification jusqu'à la mycorhize. Je pense que des espèces comme Leotia lubrica et Humaria hemisphaerica pourraient être ECM. Tu pourrais peut-être tester ces espèces-là, Pierre-Arthur.
Hans-Otto Baral,
27-06-2009 13:04
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
I remember an unidentified Mollisia species forming a well-known blackish mycorrhiza.
Zotto
Zotto
François Valade,
27-06-2009 18:26
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
PAM
j'ai envoyé Pezoloma ciliifera frais à Seppo, il y a 2 ou 3 ans , récolte au bord du lac noir aux Coches, endroit que tu connais bien.
François
j'ai envoyé Pezoloma ciliifera frais à Seppo, il y a 2 ou 3 ans , récolte au bord du lac noir aux Coches, endroit que tu connais bien.
François
Pierre-Arthur Moreau,
28-06-2009 08:26
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Merci pour vos réponses. Pour Leotia lubrica, j'ai pensé moi aussi qu'il pouvait être mycorhizique, mais sur des lots de mycorhizes d'aulnes provenant de sites où elle est très abondante, nous n'avons isolé aucune séquence correspondante. Ca n'exclut pas qu'elle puisse être mycorhizique des autres arbres présents, bien sûr.
Je pense moi aussi qu'Humaria, et même les Trichophaea, ont des habitudes de poussée qui laissent penser qu'ils sont ectomycorhiziques, mais quant à le démontrer sans l'outil moléculaire, c'est très hasardeux !
Bon dimanche, Pierre-Arthur
Je pense moi aussi qu'Humaria, et même les Trichophaea, ont des habitudes de poussée qui laissent penser qu'ils sont ectomycorhiziques, mais quant à le démontrer sans l'outil moléculaire, c'est très hasardeux !
Bon dimanche, Pierre-Arthur
Luc Bailly,
28-06-2009 09:42
Re:Helotiales mycorhiziques sur Alnus
Re: Humaria: quand on a la chance d'avoir une radicelle mycorrhirée très proche de la base de l'apothécie, on peut voir des hyphes brunes qui rejoignent la mycorrhize. C'est le seul moyen de mettre ces mycorrhizes en évidence: si les mycorrhizes sont plus éloignées, suivre le mycélium ténu, hyalin, dans l'argile, est en effet très hasardeux.